Для продажи сертификатов (депозита) можно использовать систему внутренних счетов
в программе, для этого откройте модуль "Счета" и пункт "Новый счет":

Тип - "Торговая точка", ввести Имя и создать счет по кнопке ОК:

Далее можете произвести платеж типом "Аванс" на таком внутреннем счете, с виду это обычный счет, у которого нет привязки к какому либо бронированию:

Далее, как только гость захочет воспользовать какими либо услугами гостиницы, то такой внутренний счет гостя можно найти через кнопку "Поиск" и в счете произвести начисление услуг.

А также в последних версиях появилась возможность переносить авансовые оплаты со счета на счет, т.е. к примеру будет создано резервирование в комнате, и есть возможность произвести перенос ранее проведенного аванса на счет гостя с привязкой к периоду проживания в номере: 

https://support.edelink.ru/node/64282

Еще один вариант проведения сертификатов:

• Создать доп услугу "Подарочный сертификат" (https://support.edelink.ru/node/6369),
  на отдельном внутреннем счете производить продажу такого сертификата гостям.

• Затем в Конфигураторе создать еще один вариант оплаты - "Сертификат" (https://support.edelink.ru/node/36602, без признака "Проводить по кассе").
• Как только гость с сертификатом приезжает в гостиницу - начисляем услуги и берем оплату этим не фискальным типом.
• При таком варианте стоит учитывать, что в Доходе гостиницы отразится как сумма проданных услуг "Подарочный сертификат", так и будут услуги, начисленные гостю и проданные с типом оплаты "Сертификат".